إدارة النقل البحري و الموانئ. وتختص بالآتي:

1. إعداد الدراسات المتعلقة بتطوير نشاط النقل البحري و الموانئ و متابعة تنفيذ التشريعات المتعلقة به.
2. الاشراف و المتابعة و الرقابة على شؤون الموانئ و المنائر فيما يتعلق بالمسائل السيادية و اقتراح إنشاء و صيانة الموانئ والأرصفة البحرية.
3. وضع قواعد إصدار إصدار تراخيص عمل الوحدات البحرية العائمة وكذلك قواعد ارشاد السفن والموانئ و الاعلانات البحرية.
4. تحديد ضوابط منح شهادات الأهلية للربابنة و الضباط و المهندسين و البحريين وتحديد شروط المهن البحرية اللازمة لإصدار الجوازات البحرية.
5. متابعة و إعداد الاتفاقيات الثنائية المتعلقة بالنقل البحري والموانئ.
6. متابعة نشاط الشركات العاملة في مجال النقل البحري و الموانئ و الصيانة البحرية و تقديم تقارير دورية عنها.
7. اقتراح تحديد الرسوم مقابل الخدمات التي يقدمها القطاع في مجال اختصاصه و جباية الرسوم و العوائد السيادية المنصوص عليها في التشريعات النافذة.
8. وضع القواعد المتعلقة بالتفتيش البحري و متابعة تنفيذها.
9. التنسيق مع الجهات المعنية بخدمات البحث و الإنقاذ و مكافحة التلوث البحري و التحقق في الحوادث البحرية و إعداد التقارير المتعلقة بذلك.
10. في الحوادث البحرية و إعداد التقارير المتعلقة بذلك.
11. اقتراح ميزانية التحول لمشروعات النقل البحري و الموانئ و متابعة تنفيذها.